Isti izvor je potvrdio da se Morsi tereti po nekoliko optužnica koje su trenutno predmet istrage.
Morsi se tereti za „saradnju i špijunažu sa palestinskim Hamasom“, „organiziranje napada na imovinu i objekte egipatske vojske“, kao i za „učešće u organizaciji bijega zatvorenika iz zatvora Vadi Natrun za vrijeme revolucije u januaru 2011. godine“.
Svrgnutom predsjedniku Morsiju i još 14 zvaničnika Muslimanskog bratstva (Ihvan) podignuta je i optužnica za „podsticanje ubistava demonstranata na trgu ispred egipatskog Predjedništva“.
Prvo saslušanje u sudnici najavljeno je za 4. novembrar. Morsijev advokatski tim najavio je da on neće priznati istargu, niti se braniti u ovom slučaju.