Prvi susreti šesnaestine finala na rasporedu su 14. februara 2013., a sastaju se:
BATE Borisov (Blr) – Fenerbahče (Tur)
Inter (Ita) – Cluj (Rum)
Levante (Špa) – Olympiacos (Grč)
Zenit (Rus) – Liverpool (Eng)
Dinamo Kijev (Ukr) – Bordeaux (Fra)
Bayer Leverkusen (Njem) – Benfica (Por)
Newcastle (Eng) – Metalist (Ukr)
Stuttgart (Njem) – Genk (Bel)
Atletico Madrid (Špa) – Rubin (Rus)
Ajax (Hol) – Steaua (Rum)
Basel (Švi) – Dnipro (Ukr)
Anži (Rus) – Hannover (Njem)
Sparta Prag (Češ) – Chelsea (Eng)
Borussia Mönchengladbach (Njem) – Lazio (Ita)
Tottenham (Eng) – Lyon (Fra)
Napoli (Ita) – Viktoria Plzen (Češ)
Uzvratni susreti igraju se 21. februara.
U osmini finala sastat će se:
Napoli/Plzen – BATE/Fenerbahče
Bayer Leverkusen/Benfica – Dinamo Kijev/Bordeaux
Anži/Hannover – Newcastle/Metalist
Stuttgart/Genk – Mönchengladbach/Lazio
Tottenham/Lyon – Inter/Cluj
Levante/Olympiacos – Atletico/Rubin
Basel/Dnipro – Zenit/Liverpool
Ajax/Steaua – Sparta Prag/Chelsea
Susreti osmine finala na rasporedu su 7. i 14. marta 2013.